Genoomaretusväärtuste piiratus

Genoomaretusväärtuste hindamiseks vajalikud genotüübi ja aretusväärtuste vahelised seosed on täpselt hinnatavad vaid väga suurte ühtsete referentspopulatsioonide baasil.

Sestap ei pruugi genoomselektsiooni teostamine olla mõttekas

• väikesearvulistel tõugudel (näiteks kohalikel rahvuslikel tõugudel) ja/või
• ebatraditsiooniliste tingimuste tarvis (näiteks mahefarmidele sobivate loomade aretamisel).

Lahendusena on teoreetilistes uuringutes püütud panna referentspopulatsiooni kokku mitmest tõust ning sedasi saadud markerefektide hinnangud töötavad keskmiselt hästi kõigi kaasatud tõugude puhul, aga siiski mitte nii hästi, kui vaid sama tõu alusel leitud hinnangud.

Interpull on sarnaselt erinevates riikides järglaste järgi hinnatud aretusväärtuste transformeerimise mudelitele (MACE) võtnud analoogse metoodika kasutusele ka genoomaretusväärtuste tarvis (GMACE).

Siiski on genoomaretusväärtuste puhul keeruline erinevate populatsioonide (riikide, tõugude) põhiste hinnangute võrdlemine ja erinevate söötmis-pidamistingimuste tarvis sobivamate indiviidide selekteerimine.