ETF grant 4095: "Läänemere ohustatud anadroomsete lõheliste looduslike ja kasvatatavate populatsioonide geneetiline struktuur ja mitmekesisus" (R. Gross) 2000-2003
ETF grant 4826: "Vikerforelli ja karpkala tõugude võrdlev hindamine ning Eesti tingimuste jaoks sobivate vormide valik" (T. Paaver) 2001-2004
ETF grant 5729: "Kalade liigisisese mitmekesisuse molekulaargeneetilised uuringud kaitse ja säästliku kasutamise huvides" (R. Gross) 2004-2007
ETF grant 6155: "Jõevähi Astacus astacus kasvatuse tehnoloogia täiustamine" (T. Paaver) 2005-2007
ETF grant 5732: "Kalade tabandatuse uurimine inimese ja koduloomade tervisele ohtliku parasiidi, hariliku laiussi (Diphyllobothrium latum) noorvormidega Emajõe vesikonna veekogudes" (J. Kasesalu) 2004 -2005.